走向第四范式：數(shù)據(jù)密集型科學(xué)研究

目錄
第1章數(shù)據(jù)密集型科研范式概述
1.1 科研范式的演變過(guò)程 2
1.1.1 科學(xué)研究的概念 2
1.1.2 范式的內(nèi)涵與轉(zhuǎn)換 3
1.1.3 科研范式的演變 4
1.2 數(shù)據(jù)密集型科研范式的產(chǎn)生 8
1.2.1 數(shù)據(jù)密集型科研范式的產(chǎn)生背景 8
1.2.2 數(shù)據(jù)密集型科研范式的提出 28
1.3數(shù)據(jù)密集型科研范式的核心內(nèi)容 30
1.4 數(shù)據(jù)密集型科研范式的特征 33
1.4.1 研究客體的變化 34
1.4.2 科研驅(qū)動(dòng)方式的變化 34
1.4.3 數(shù)據(jù)要求的變化 35
1.4.4 研究手段的變化 35
1.4.5科學(xué)發(fā)現(xiàn)模式的變化 35
1.4.6 科研組織模式的變化 36
1.5數(shù)據(jù)密集型科研范式對(duì)科學(xué)研究的影響 36
1.5.1 催生出科學(xué)研究新場(chǎng)景 37
1.5.2 數(shù)據(jù)被視為研究基礎(chǔ)設(shè)施 38
1.5.3 提高了科研相關(guān)方對(duì)數(shù)據(jù)重視的程度 38
1.5.4 給學(xué)術(shù)信息交流帶來(lái)的深刻變化 39
1.5.5 對(duì)支撐科學(xué)研究的數(shù)字基礎(chǔ)設(shè)施提出更全面的需求 40
1.5.6 推動(dòng)全球“開(kāi)放科學(xué)”運(yùn)動(dòng) 40
第2章數(shù)據(jù)密集型科研環(huán)境發(fā)展態(tài)勢(shì)
2.1 積極制定大數(shù)據(jù)發(fā)展戰(zhàn)略規(guī)劃 46
2.2 國(guó)內(nèi)外持續(xù)加強(qiáng)數(shù)字科研基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè) 48
2.3全球數(shù)據(jù)管理與開(kāi)放共享運(yùn)動(dòng)快速發(fā)展 55
2.3.1 數(shù)據(jù)管理與開(kāi)放共享政策的制定 55
2.3.2 數(shù)據(jù)管理機(jī)構(gòu)與數(shù)據(jù)中心的建設(shè) 58
2.4 數(shù)據(jù)密集型科研呈現(xiàn)開(kāi)放與包容的發(fā)展態(tài)勢(shì) 62
2.5數(shù)據(jù)密集型科研面臨多方面挑戰(zhàn) 65
第3章支撐數(shù)據(jù)密集型科研的數(shù)字基礎(chǔ)設(shè)施典型案例
3.1 通用數(shù)字科研基礎(chǔ)設(shè)施 70
3.1.1 歐洲開(kāi)放科學(xué)云 70
3.1.2 歐盟第七框架項(xiàng)目 80
3.1.3 歐洲開(kāi)放獲取基礎(chǔ)設(shè)施研究項(xiàng)目 84
3.1.4 美國(guó)俄亥俄超級(jí)計(jì)算機(jī)中心 86
3.2 專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域數(shù)字科研基礎(chǔ)設(shè)施 89
3.2.1 歐洲生命科學(xué)大數(shù)據(jù)聯(lián)盟基礎(chǔ)設(shè)施 89
3.2.2 歐洲開(kāi)放科學(xué)云-生命科學(xué)領(lǐng)域 91
3.2.3 環(huán)境研究基礎(chǔ)設(shè)施 93
3.2.4 綜合碳監(jiān)測(cè)系統(tǒng) 96
3.2.5 AGINFRA+ 98
3.2.6 邁向農(nóng)業(yè)開(kāi)放科學(xué)的電子基礎(chǔ)設(shè)施路線(xiàn)圖 99
3.2.7 AgGateway 102
3.2.8 歐洲植物表型組學(xué)會(huì) 103
3.2.9 LifeWatch 105
3.3數(shù)字科研基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)啟示 106
3.3.1 強(qiáng)化云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)的應(yīng)用 107
3.3.2 強(qiáng)調(diào)遵循數(shù)據(jù)的開(kāi)放獲取和FAIR原則 108
3.3.3 注重?cái)?shù)據(jù)和服務(wù)間的互操作性和標(biāo)準(zhǔn)化 109
3.3.4 重視基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)的整體統(tǒng)籌和長(zhǎng)期可持續(xù)性 109
第4章數(shù)據(jù)密集型科研典型應(yīng)用案例及啟示
4.1 數(shù)據(jù)密集型科研典型應(yīng)用案例 114
4.1.1 地球大數(shù)據(jù)科學(xué)工程 114
4.1.2 **張黑洞真實(shí)照片 116
4.1.3 歐盟“人腦計(jì)劃”項(xiàng)目 118
4.1.4 醫(yī)療大數(shù)據(jù)應(yīng)用技術(shù)國(guó)家工程 123
4.1.5農(nóng)業(yè)氣候和經(jīng)濟(jì)建模 124
4.1.6 食品安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估 125
4.1.7 水稻計(jì)算育種 126
4.1.8 華大基因工程 127
4.1.9 大科學(xué)項(xiàng)目斯隆數(shù)字巡天 128
4.1.10 數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)型農(nóng)業(yè)物聯(lián)網(wǎng)應(yīng)用 129
4.2 數(shù)據(jù)密集型科研典型應(yīng)用案例啟示 130
4.2.1 重視虛擬科研環(huán)境搭建 131
4.2.2 加強(qiáng)科研數(shù)據(jù)體系建設(shè) 131
4.2.3 著重提升數(shù)據(jù)計(jì)算分析能力 132
4.2.4 強(qiáng)化大數(shù)據(jù)關(guān)鍵技術(shù)應(yīng)用 133
第5章數(shù)據(jù)密集型農(nóng)業(yè)科研應(yīng)用
5.1 數(shù)據(jù)密集型農(nóng)業(yè)科研的新需求 136
5.1.1 注重多學(xué)科領(lǐng)域的協(xié)同創(chuàng)新 136
5.1.2 加強(qiáng)數(shù)字科研共享基礎(chǔ)設(shè)施的建設(shè) 137
5.1.3 強(qiáng)化信息技術(shù)與領(lǐng)域技術(shù)的深度融合 138
5.1.4 重視數(shù)據(jù)和智能雙向驅(qū)動(dòng)的科研體系建設(shè) 139
5.1.5 重視數(shù)據(jù)密集型計(jì)算模型的構(gòu)建 140
5.2 數(shù)據(jù)密集型農(nóng)業(yè)科研平臺(tái)典型架構(gòu) 140
5.3數(shù)據(jù)密集型農(nóng)業(yè)科研應(yīng)用場(chǎng)景 144
5.3.1 作物計(jì)算育種 144
5.3.2 多組學(xué)大數(shù)據(jù)與表型性狀關(guān)聯(lián)分析 145
5.3.3 植物病蟲(chóng)害監(jiān)測(cè)預(yù)警 146
5.3.4 農(nóng)業(yè)綠色發(fā)展智能預(yù)測(cè) 147
5.3.5 基因工程疫苗協(xié)同研發(fā) 148
第6章結(jié)語(yǔ)與展望
6.1發(fā)達(dá)國(guó)家高度重視和關(guān)注數(shù)據(jù)密集型研究 152
6.1.1 美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金會(huì)對(duì)數(shù)據(jù)密集型科學(xué)計(jì)算的持續(xù)支持 152
6.1.2 歐洲網(wǎng)格基礎(chǔ)設(shè)施發(fā)布促進(jìn)數(shù)據(jù)及計(jì)算密集型科學(xué)發(fā)展的策略 153
6.1.3 英國(guó)科學(xué)和技術(shù)設(shè)施理事會(huì)提出數(shù)據(jù)密集型科學(xué)的發(fā)展方向 154
6.1.4 美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館致力于數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)科研平臺(tái)的規(guī)劃與實(shí)現(xiàn) 155
6.2 加快推進(jìn)數(shù)據(jù)密集型科研發(fā)展的建議 158
6.2.1 加強(qiáng)政策創(chuàng)設(shè)，強(qiáng)化體制機(jī)制創(chuàng)新 158
6.2.2 加強(qiáng)科研基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)及開(kāi)放共享 160
6.2.3 加強(qiáng)標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范的制定與數(shù)字服務(wù)體系建設(shè) 162
6.2.4 積極推進(jìn)科研組織模式轉(zhuǎn)型與人才隊(duì)伍建設(shè) 163
參考文獻(xiàn) 167