動物脂肪沉積與RNA甲基化調控

序
前言
1 動物脂肪沉積概述
1.1 動物脂肪組織及功能
1.1.1 脂肪組織的類型及分布
1.1.2 脂肪細胞的功能
1.2 動物脂肪沉積及其調控
1.2.1 脂肪細胞的來源
1.2.2 脂肪沉積的調控
1.2.3 畜禽脂肪沉積
1.3 常用研究技術與方法
1.3.1 脂肪組織前體脂肪細胞的獲取
1.3.2 纖維/脂肪生成祖細胞的獲取
1.3.3 脂肪細胞培養(yǎng)技術
1.3.4 成脂表型檢測
參考文獻
2 RNA甲基化概述
2.1 國內外研究進展
2.1.1 RNA甲基化
2.1.2 RNAm6A修飾
2.1.3 RNAm5C修飾
2.2 常用研究技術與方法
2.2.1 斑點雜交印跡法
2.2.2 高效液相色譜-串聯質譜法
2.2.3 熒光比色法
2.2.4 甲基化RNA免疫共沉淀
2.2.5 甲基化RNA單核苷酸分辨率交聯免疫共沉淀
2.2.6 重亞硫酸氫鹽測序
2.2.7 RNA穩(wěn)定性檢測
2.2.8 多聚核糖體組分分析
參考文獻
3 RNA甲基化調控豬脂肪沉積及其機制
3.1 RNA甲基化負調控豬脂肪細胞分化聚酯
3.1.1 FTO對mRNAm6A水平及豬脂肪細胞分化聚酯的影響
3.1.2 METTL3對mRNA m6A水平及豬脂肪細胞分化聚酯的影響
3.1.3 mRNAm6A甲基化和豬脂肪細胞分化聚酯的外源性調控
3.2 RNA甲基化調控豬皮下脂肪沉積及其機制
3.2.1 兩個豬種的表型及mRNAmA甲基化組特征
3.2.2 m6A負調控UCP2蛋白表達，影響豬脂肪沉積
3.2.3 m6A正調控PNPLA2蛋白表達，影響豬脂肪沉積
3.2.4 討論
3.3 RNA甲基化調控豬肌內脂肪沉積及其機制
3.3.1 mRNA m6A修飾水平負調控肌內脂肪沉積
3.3.2 豬肌肉m6A 甲基化測序（MeRIP-seq)及數據分析
3.3.3 兩個豬種m5A修飾差異基因MTCH2促進肌內脂肪沉積
3.3.4 m6A通過依賴于YTHDF1的方式促進MTCH2翻譯
3.3.5 討論
參考文獻
4 RNA甲基化調控豬脂肪細胞發(fā)育及其機制
4.1 RNA甲基化調控豬多能干細胞（piPSC）分化
4.1.1 METTL3是piPSC自我更新和多能性所必需的
4.1.2 METTL3通過 STAT3-KLF4-SOX2信號軸調節(jié)piPSC多能性
4.1.3 METTL3靶向JAK2和SOCS3調控STAT3-KLF4-SOX2通路
4.1.4 METTL3以m6A依賴的方式介導JAK2和SOSC3的蛋白表達
4.1.5 YTHDF1/YTHDF2介導JAK2和SOCS3的表達
4.1.6 討論
4.2 RNA甲基化調控豬間充質干細胞（pBMSC）成脂分化
4.2.1 METTL3負調控pBMSC成脂分化
4.2.2 METTL3通過m6A調控JAK1/p-STAT5/CEBPB通路
4.2.3 討論
4.3 RNA甲基化調控豬前體脂肪細胞分化聚酯
4.3.1 FTO在前體脂肪細胞分化早期調控脂肪生成
4.3.2 FTO通過激活p-STAT3和CEBPB表達調控脂肪細胞分化
4.3.3 FTO通過靶向JAK2調控JAK2-STAT3-CEBPB通路
4.3.4 FTO依賴m6A去甲基化酶活性調控JAK2表達
4.3.5 m6A以YTHDF2依賴的方式促進JAK2mRNA降解
4.3.6 討論
參考文獻
5 RNA甲基化調控前體脂肪細胞到成熟脂肪細胞分化及其機制
5.1 RNA甲基化調控細胞周期影響脂肪細胞分化
5.1.1 FTO通過調控細胞周期影響脂肪細胞成脂分化
5.1.2 FTO以m6A依賴方式介導Ccna2和Cdk2基因表達
5.1.3 YTHDF2介導FTO對脂肪細胞分化聚酯的調控作用
5.1.4 討論
5.2 ZFP217通過RNA甲基化調控脂肪細胞成脂
5.2.1 敲低Zfp217阻滯細胞周期從而抑制脂肪細胞分化
5.2.2 敲低Zfp217以METTL3-m6A依賴方式抑制CCND1表達
5.2.3 YTHDF2降低CcndlmRNA的穩(wěn)定性，減少蛋白表達
5.2.4 敲低Ythdf2逆轉ZFP217缺失對脂肪細胞分化的抑制作用
5.2.5 討論
5.3 RNA甲基化通過影響CdknlamRNA出核及翻譯調控脂肪細胞成脂
5.3.1 NSUN2負調控3T3-L1細胞的脂肪生成
5.3.2 NSUN2通過阻斷克隆增殖過程來調控脂肪生成
5.3.3 NSUN2以mC依賴的方式促進CDKN1A蛋白的表達
5.3.4 m5C閱讀蛋白ALYREF促進Cdknla mRNA的出核
5.3.5 討論
參考文獻
6 RNA甲基化影響自噬及代謝過程調控動物肥胖
6.1 RNA甲基化靶向Atg5/Atg7影響細胞自噬進而調控動物肥胖
6.1.1 FTO上調自噬并進一步促進脂肪細胞分化
6.1.2 FTO正調控ATG5和ATG7的表達
6.1.3 FTO通過靶向ATG5和ATG7影響自噬和脂肪生成
6.1.4 FTO以m6A依賴的方式調節(jié)ATG5和ATG7的表達
6.1.5 YTHDF2介導Atg5和Atg7的mRNA穩(wěn)定性和表達
6.1.6 Fro-AKO降低小鼠脂肪量，抑制ATG5和ATG7依賴性自噬
6.1.7 討論
6.2 RNA甲基化靶向HIF1a影響能量代謝調控動物肥胖
6.2.1 脂肪組織特異性Fto敲除對高脂飲食誘導的肥胖具有保護作用
6.2.2 Fto基因敲除促進白色脂肪細胞棕色化并增強代謝水平
6.2.3 Fto基因敲除通過激活HIF1A誘導產熱基因表達
6.2.4 HIF1A作為轉錄調控元件正向調控產熱基因表達
6.2.5 FTO通過m6A修飾抑制HI