食品分子微生物學(xué)

第1章 緒論
1．1 食品微生物學(xué)的歷史
1．1．1 食品微生物的發(fā)現(xiàn)
1．1．2 食品微生物學(xué)的發(fā)展歷史
1．2 食品分子微生物學(xué)的發(fā)展
1．2．1 分子生物學(xué)的發(fā)展
1．2．2 食品分子微生物學(xué)發(fā)展中重要的分子生物學(xué)技術(shù)
1．3 食品分子微生物學(xué)的研究?jī)?nèi)容與應(yīng)用
1．3．1 食品微生物的分子鑒定
1．3．2 食品微生物的基因組學(xué)
1．3．3 食品微生物的群體生態(tài)分子機(jī)制
1．3．4 食品微生物的特殊存活狀態(tài)及其分子機(jī)制
1．3．5 食品微生物對(duì)脅迫環(huán)境的應(yīng)激性反應(yīng)
1．3．6 食品微生物的分子改良
1．3．7 食品微生物的分子檢測(cè)技術(shù)
復(fù)習(xí)思考題
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第2章 食品微生物學(xué)常用的分子生物學(xué)技術(shù)
2．1 核酸提取技術(shù)
2．1．1 核酸的分類(lèi)與存在形式
2．1．2 核酸的提取
2．1．3 核酸的檢測(cè)
2．2 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR）技術(shù)
2．2．1 PCR技術(shù)的發(fā)展簡(jiǎn)史
2．2．2 PCR技術(shù)的原理
2．3 分子克隆技術(shù)
2．3．1 分子克隆技術(shù)原理
2．3．2 工具酶
2．3．3 基因載體
2．3．4 基因表達(dá)系統(tǒng)
2．4 同源重組技術(shù)
2．4．1 RecA同源重組系統(tǒng)
2．4．2 RecE同源重組系統(tǒng)
2．4．3 Red同源重組系統(tǒng)
復(fù)習(xí)思考題
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第3章 食品微生物的分子鑒定與分型
3．1 食品微生物分類(lèi)方法概述
3．2 rRNA序列分析
3．2．1 16S rRNA和18S rRNA的序列分析
3．2．2 NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)
3．3 非rRNA序列分析
3．3．1 腸桿菌基因間保守重復(fù)序列
3．3．2 規(guī)律成簇間隔短回文重復(fù)序列分析
3．3．3 內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)
3．3．4 葡萄球菌A蛋白基因
3．3．5 多位點(diǎn)序列分析
3．3．6 基于看家基因的弧菌鑒定法
3．4 分子分型技術(shù)
3．4．1 脈沖場(chǎng)凝膠電泳分析
3．4．2 限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析
3．4．3 擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析
3．4．4 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA分析
3．4．5 單鏈構(gòu)象多態(tài)性分析
3．4．6 PCR電噴霧電離質(zhì)譜分型技術(shù)
3．4．7 多位點(diǎn)可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列分析
3．4．8 不同分型方法的聯(lián)合應(yīng)用
復(fù)習(xí)思考題
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第4章 食品微生物的基因組學(xué)
4．1 基因組學(xué)的定義
4．2 食源性致病菌的基因組學(xué)
4．2．1 大腸桿菌和志賀氏菌的基因組學(xué)
4．2．2 沙門(mén)氏菌的基因組學(xué)
4．2．3 李斯特菌屬的基因組學(xué)
4．2．4 葡萄球菌的基因組學(xué)
4．2．5 致病性弧菌的基因組學(xué)
4．2．6 致病性芽孢桿菌基因組學(xué)
4．3 食品中有益菌的基因組學(xué)
4．3．1 乳酸桿菌的基因組學(xué)
4．3．2 乳酸乳球菌的基因組學(xué)
4．3．3 嗜熱鏈球菌的基因組學(xué)
4．3．4 雙歧桿菌的基因組學(xué)
復(fù)習(xí)思考題
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第5章 食品微生物的群體生態(tài)分子機(jī)制
5．1 宏基因組
5．1．1 宏基因組的概念
5．1．2 宏基因組研究方法
5．1．3 微生物宏基因組學(xué)在食品科學(xué)研究中的應(yīng)用
5．2 群體感應(yīng)
5．2．1 微生物群體感應(yīng)的概念
5．2．2 群體感應(yīng)的分子機(jī)制
5．2．3 群體感應(yīng)的生物學(xué)效應(yīng)
5．2．4 群體感應(yīng)干擾及其在食品質(zhì)量安全控制中的應(yīng)用
5．3 基因水平轉(zhuǎn)移
5．3．1 微生物的可移動(dòng)遺傳元件
5．3．2 基因水平轉(zhuǎn)移的方式與機(jī)制
5．3．3 基因水平轉(zhuǎn)移的作用與影響
復(fù)習(xí)思考題
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第6章 食品微生物的特殊存活狀態(tài)及其分子機(jī)制
6．1 芽孢
6．1．1 芽孢的概念及特征
6．1．2 芽孢的形成及其分子機(jī)制
6．1．3 芽孢的萌發(fā)及其分子機(jī)制
6．1．4 食品中芽孢的控制方法
6．2 生物被膜
6．2．1 生物被膜的特征
6．2．2 生物被膜的形成及其分子機(jī)制
6．2．3 生物被膜的控制方法
6．2．4 生物被膜的檢測(cè)方法
6．3 活的但不可培養(yǎng)（VBNC）菌
6．3．1 VBNC菌的特征
6．3．2 食品中VBNC菌的產(chǎn)生
6．3．3 VBNC菌的復(fù)活
復(fù)習(xí)思考題
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第7章 食品微生物對(duì)脅迫環(huán)境的應(yīng)激性反應(yīng)
7．1 微生物熱應(yīng)激機(jī)制
7．1．1 微生物熱應(yīng)激簡(jiǎn)介
7．1．2 熱激蛋白
7．1．3 海藻糖
7．1．4 應(yīng)激糖蛋白
7．2 微生物冷應(yīng)激機(jī)制
7．2．1 微生物冷應(yīng)激簡(jiǎn)介
7．2．2 脂肪酸成分的改變
7．2．3 溶質(zhì)跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)
7．2．4 冷激蛋白
7．3 微生物高滲透壓和干燥應(yīng)激機(jī)制
7．3．1 高滲透壓和干燥對(duì)微生物的影響
7．3．2 微生物高滲透壓應(yīng)激機(jī)制
7．3．3 微生物干燥應(yīng)激機(jī)制
7．4 微生物酸脅迫應(yīng)激機(jī)制
7．4．1 微生物酸脅迫簡(jiǎn)介
7．4．2 改變細(xì)胞壁和細(xì)胞膜的成分
7．4．3 質(zhì)子泵
7．4．4 脫羧反應(yīng)和脫氨基反應(yīng)
7．4．5 改變基因表達(dá)及蛋白調(diào)控
7．4．6 熱休克蛋白對(duì)細(xì)胞酸脅迫的保護(hù)機(jī)制
7．5 微生物氧化脅迫應(yīng)激機(jī)制
7．5．1 氧化脅迫簡(jiǎn)介
7．5．2 抗氧化酶清除劑
7．5．3 非酶清除劑
7．6 微生物輻射脅迫應(yīng)激機(jī)制
7．6．1 微生物輻射脅迫簡(jiǎn)介
7．6．2 細(xì)菌對(duì)輻射脅迫的應(yīng)激機(jī)制
7．6．3 真菌對(duì)輻射脅迫的應(yīng)激機(jī)制
7．6．4 以極端微生物耐輻射奇球菌為例的抗輻射應(yīng)激機(jī)制
7．7 微生物其他應(yīng)激機(jī)制
7．7．1 營(yíng)養(yǎng)脅迫
7．7．2 膽汁脅迫與應(yīng)激
7．7．3 重金屬脅迫與應(yīng)激
復(fù)習(xí)思考題
參考文獻(xiàn)
第8章 新興分子生物學(xué)技術(shù)在食品微生物中的應(yīng)用
8．1 新一代測(cè)序技術(shù)
8．1．1 測(cè)序技術(shù)的歷史及第一代測(cè)序技術(shù)
8．1．2 新一代測(cè)序技術(shù)
8．1．3 新一代測(cè)序技術(shù)在食品微生物研究中的主要應(yīng)用
8．2 組學(xué)技術(shù)
8．2．1 基因組學(xué)
8．2．2 轉(zhuǎn)錄組學(xué)
8．2．3 蛋白質(zhì)組學(xué)
8．3 新型基因組編輯技術(shù)
8．3．1 新型基因組編輯技術(shù)概述
8．3．2 ZFNs技術(shù)
8．3．3 TALENs技術(shù)
8．3．4 CRISPR／Cas系統(tǒng)
8．3．5 三種編輯技術(shù)的比較
復(fù)習(xí)思考題
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第9章 食品微生物的分子改良
9．1 概述
9．2 食品微生物分子改良的基本原理
9．3 食品微生物分子改良的技術(shù)方法
9．3．1 優(yōu)良菌株的誘變選育
9．3．2 靶基因高效表達(dá)工程菌株的構(gòu)建
9．3．3 細(xì)胞表面展示技術(shù)
9．3．4 蛋白質(zhì)的體外定向分子改造
9．3．5 代謝途徑改造
9．4 食品微生物工程菌株的應(yīng)用
9．4．1 食品微生物工程菌株生產(chǎn)工業(yè)原料
9．4．2 食品微生物工程菌株生產(chǎn)酶制劑
9．4．3 食品微生物工程菌株生產(chǎn)功能分子
9．4．4 食品微生物工程菌株改善發(fā)酵食品的風(fēng)味與品質(zhì)
復(fù)習(xí)思考題
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第10章 食品微生物的分子檢測(cè)技術(shù)
10．1 PCR及其拓展檢測(cè)技術(shù)
10．1．1 PCR檢測(cè)技術(shù)
10．1．2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)技術(shù)
10．1．3 核酸染料結(jié)合實(shí)時(shí)熒光定量PCR的活菌檢測(cè)技術(shù)
10．1．4 多重PCR檢測(cè)技術(shù)
10．1．5 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)
10．2 熒光原位雜交（FISH）技術(shù)
10．2．1 FISH技術(shù)的原理
10．2．2 FISH技術(shù)的發(fā)展
10．3 酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定（ELISA）
10．3．1 ELISA的原理
10．3．2 ELISA技術(shù)的分類(lèi)與應(yīng)用
10．4 生物傳感器
10．4．1 光學(xué)生物傳感器
10．4．2 電化學(xué)生物傳感器
10．4．3 壓電生物傳感器
10．5 基于噬菌體的檢測(cè)技術(shù)
10．5．1 熒光噬菌體檢測(cè)技術(shù)
10．5．2 其他噬菌體檢測(cè)技術(shù)
10．6 生物芯片檢測(cè)技術(shù)
10．6．1 微陣列芯片
10．6．2 液體芯片
復(fù)習(xí)思考題
參考文獻(xiàn)