水稻DNA指紋及應(yīng)用

第一章　DNA指紋圖譜概述
　第一節(jié)　DNA指紋圖譜的產(chǎn)生
　　一、可變重復(fù)序列的發(fā)現(xiàn)
　二、DNA指紋圖譜的建立
　第二節(jié)　DNA指紋圖譜的發(fā)展
　　一、形態(tài)學(xué)標(biāo)記(Mollahological matkers)
　　二、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記(Cytological markers)
　　三、生化標(biāo)記(Biochemical markers)
　　四、DNA分子標(biāo)記(Molecular markers)
　第三節(jié)　DNA指紋圖譜的特點(diǎn)
　　一、DNA指紋圖譜的基本特點(diǎn)
　　二、DNA分子標(biāo)記的優(yōu)點(diǎn)
　　三、DNA分子標(biāo)記的要求
　第四節(jié)　DNA指紋圖譜應(yīng)用
　　一、法醫(yī)學(xué)
　　二、動(dòng)植物科學(xué)
　　三、流行病學(xué)
第二章　DNA指紋技術(shù)類型
　第一節(jié)　DNA指紋技術(shù)分類
　　一、根據(jù)檢測(cè)手段及相關(guān)技術(shù)分類
　　二、根據(jù)DNA指紋技術(shù)的發(fā)展分類
　第二節(jié)　常見的DNA指紋技術(shù)
　　一、限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(Restriction fragment length polymorophism，RFLP)
　　二、單鏈構(gòu)象多態(tài)性(Single strand conformation polymorphism，SSCP)
　　三、變性梯度凝膠電泳(Denaturing gradient gel electrophoresis，DGGE)
　　四、原位雜交(in situ Hybridation，ISH)
　　五、序列標(biāo)記位點(diǎn)(Sequence—tagged site，STS)
　　六、隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(Random amplified polymorphic DNA，RAPD)
　　七、序列特征化擴(kuò)增區(qū)域(Sequence charactered amplified region，SCAR)技術(shù)
　　八、隨即引物PCR(Random primer PCR．RP-PCR)
　　九、DNA擴(kuò)增指紋技術(shù)(DNA amplification finger-printing，DAF)
　　十、擴(kuò)增的限制性內(nèi)切酶片段長(zhǎng)度多態(tài)性(Amplified fragment length polymorphism，AFLP)
　　十一、簡(jiǎn)單序列重復(fù)(Simple sequence repeat，SSR)
　　十二、簡(jiǎn)單重復(fù)序列間區(qū)(Inter—simple sequence repeat，ISSR)
　　十三、逆轉(zhuǎn)錄PCR(Reverse transcription PCR．RT．PCR)
　　十四、差異顯示逆轉(zhuǎn)錄PCR(Differential display reverse transcription PCR，DDRT-PCR)
　　十五、表達(dá)序列標(biāo)簽(Expressed sequence tags，EST)
　　十六、單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism，SNP)
　第三節(jié)　新型的DNA指紋技術(shù)
　　一、抗病基因同源序列(Resistance gene analogs，RGAs)
　　二、隨機(jī)微衛(wèi)星擴(kuò)增多態(tài)DNA(Random microsatellite amplify polymorphic DNA，RMAPD)
　　三、相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性(Sequence related amplifiedpolymorphism，SRAP)
　　四、靶位區(qū)域擴(kuò)增多態(tài)性(Target region amplified polymorphism，TRAP)
第三章　DNA指紋圖譜數(shù)據(jù)分析
　第一節(jié)　遺傳標(biāo)記的分類
　　一、質(zhì)量性狀
　　二、數(shù)量性狀
　第二節(jié)　遺傳標(biāo)記研究方法
　　一、遺傳相似分析
　　二、遺傳標(biāo)記間相關(guān)性
第四章　SSR與水稻遺傳多樣性研究
　第一節(jié)　植物遺傳多樣性研究
　　一、植物遺傳多樣性研究意義
　　二、植物遺傳多樣性研究手段
　　三、遺傳多樣性分析方法
　第二節(jié)　SSR標(biāo)記對(duì)稻屬AA染色體組個(gè)種間多樣性與親緣關(guān)系分析
　　一、稻屬的分類及種質(zhì)資源
　　二、SSR與水稻遺傳多樣性研究進(jìn)展
　　三、稻屬AA染色體組8個(gè)種間多樣性與親緣關(guān)系分析
　第三節(jié)　SSR標(biāo)記對(duì)粳稻遺傳多樣性的研究
　　一、研究背景及意義
　　二、SSR與粳稻遺傳多樣性
　第四節(jié)　秈稻品種的遺傳多樣性分析
　　一、秈稻遺傳多樣性研究背景
　　二、SSR與秈稻遺傳多樣性
　第五節(jié)　SSR標(biāo)記對(duì)稽稻分類地位的研究
　　一、研究背景及意義
　　二、稽稻分類地位的研究
第五章　DNA分子標(biāo)記與常規(guī)育種技術(shù)相結(jié)合快速聚合抗性基因
　第一節(jié)　水稻主要病蟲害抗性遺傳與多抗育種發(fā)展現(xiàn)狀
　　一、稻瘟病抗性遺傳與育種
　　二、白葉枯病抗性遺傳與育種
　　三、稻飛虱抗性遺傳與育種
　　四、多抗育種發(fā)展現(xiàn)狀
　第二節(jié)　利用CAPS標(biāo)記和花藥培養(yǎng)相結(jié)合的方法快速聚合水稻抗性基因
　　一、xa-5基因的分子標(biāo)記與精細(xì)定位和克隆
　　二、xa-5分子標(biāo)記與花藥培養(yǎng)相結(jié)合培育優(yōu)質(zhì)多抗水稻
　　三、討論
參考文獻(xiàn)